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结核易感基因多态性与新疆哈萨克族结核病易感性的相关性研究

发布时间:2020-02-14 18:50
【摘要】:背景:结核病是主要的公共健康问题,每年有1000万新病例被诊断为结核病,造成200万受害者的死亡代价。然而,据估计在最初已经感染了结核分枝杆菌的20亿人中,只有5%到10%进展成为有症状的结核病。为什么有一些感染的个体进展成为活动性的疾病而其他人却没有,具体原因至今仍然不完全清楚。结核病在不同人种、种族和家族中以不同的比率发生表明了遗传素质对结核易感性可能有重要作用。结核分枝杆菌与环境和宿主遗传因素复杂的交互作用在结核病发展中扮演着关键性的作用。宿主遗传因素至少部分解释了为什么一些人对感染更敏感或不敏感。结核易感基因在结核病发生发展过程中具有重要作用。已知功能研究和作用机制比较明确的宿主基因有自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein1, NRAMP1)基因、维生素D受体(vitamin D receptor, VDR)基因、]HLA(human leukocyte antigen, HLA)-DRB1和HLA-DQB1基因等,结核病发生发展与这些基因某些位点多态性有关联,国内外多个研究团队对于基因多态性与结核病易感性的相关性开展了大量研究,然而研究结果在不同的人种和种族并不一致,有的结果甚至截然相反,显示出这些宿主基因多态性与结核病易感性之间的种族差异性,因此本研究主要探讨结核易感基因与新疆哈萨克族结核病之间的关联。 目的:研究NRAMP1基因的3’端非编码区(3'untranslated region,3'UTR)、VDR基因(Fokl、TaqI位点)、HLA-DRB1和HLA-DQB1基因多态性与哈族人群结核病易感性是否相关。 方法:采用病例-对照研究的思路设计实验。对于NRAMP1基因3’UTR位点,VDR基因两个多态性(FokI、TaqI)位点进行基因分型选择聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)分析的方法;而对于HLA-DRB1和HLA-DQB1基因进行基因分型则采用聚合酶链反应-序列特异性引物(Polymerase chain reaction-sequence specific primers, PCR-SSP)分析的方法。采用x2检验等统计方法分析NRAMP1基因3'UTR、VDR基因(FokI、TaqI位点)及HLA-DRB1和HLA-DQB1基因多态性与哈族结核病易感性的关系。 结果:1.NRAMP1基因3’UTR位点多态性在病例组与对照组问的分布差异有统计学意义(P=0.002, OR=1.859,95%CI=1.182-2.926). NRAMPI基因3'UTR位点的TGTG-频率在病例组高于对照组,组间差异有统计学意义(P=0.000)。2. VDR基因FokI位点多态性在病例组与对照组间的分布差异有统计学意义(P=0.001,OR=1.530,95%CI=1.007-2.325)。VDR基因TaqI位点多态性在病例组与对照组间的分布差异无统计学意义(P0.05)。VDR基因FokI位点的f等位基因频率在病例组和对照组中的分布差异有统计学意义(P=0.000);而VDR基因TaqI位点的t等位基因频率在病例组低于对照组,组间差异无统计学意义(P=0.260)。3.病例组HLA-DRB1*04和HLA-DQB1*0201等位基因频率明显高于对照组,有统计学意义(P=0.011and0.002, OR=1.889and1.802,95%CI=1.153-3.095and1.230-2.639)。 结论:在新疆哈萨克族人群中,NRAMPI基因3'UTR位点多态性可能与结核病易感性有关联,携带TGTG-等位基因增加了患结核病的风险;VDR基因的FokI位点多态性可能与结核病易感性相关,携带f等位基因增加了该人群患结核病的风险;TaqI位点多态性与结核病易感性不相关;VDR基因这两个多态性位点之间不存在连锁不平衡;携带HLA-DRB1*04和HLA-DQB1*0201等位基因增加了该人群患结核病的风险。
【图文】:

酶切电泳,产物,片段,结果研究


华中科技大学博士学位论文结果基因多态性憸切分析结果.1 NRAMP1基因3’ UTR位点多态性酶切分析结果研究人群中发现NRAMP1基因3’UTR位点存在三种基因型:TGTG-/-、TGTG+/-、GTG+/+0用限制性内切酶Fokl消化PCR产物,结果显示:如果TGTG缺失则不存Fokl酶切位点,PCR产物被酶切后电泳出现240bp—个片段;而TGTG无缺失则存在Fokl酶切位点,,PCR产物被酶切后电泳出现211bp和33bp两个片段。杂合基因则产生240bp,211bp和33bp三个片段。酶切结果见图1。

酶切电泳,基因,产物,位点


图2 VDR基因(Fokl) PCR产物的酶切电泳图M;DNA marker; 1: ff 型;2,4: FF 型;3: Ff 型DR基因TaqI位点多态性憸切分析结果研宄人群中发现VDR基因TaqI位点存在三种基因型:TT、Tt、tt。用限制性TaqI消化PCR产物,结果显示:如果TaqI位点的T/C单核苷酸位点处是C,TaqI酶切位点,PCR产物被酶切后电泳形成290bp及165bp两个片段;如果核苷酸处是T,则没有TaqI酶切位点,PCR产物被酶切后电泳形成455bp段。杂合基因型则产生455bp,290bp及165bp三个片段。酶切结果见图3。SOO bp > 'C ASS 1>P
【学位授予单位】:华中科技大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R52

【参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 王春梅,李辉,曹峰林;HLA—Ⅲ类基因多态性与汉族肺结核病易感性关系的研究[J];哈尔滨医药;1999年01期

2 刘丽红,孙晶,施秀琴,曹峰林;HLA与结核病相关性研究[J];哈尔滨医药;2001年01期

3 陈雪融;冯玉麟;马s

本文编号:2579581


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