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人卵巢癌OVCAR3细胞FOXM1相关差异miRNA表达谱分析鉴定

发布时间:2018-06-14 01:07  文章来源:笔耕文化传播

  本文选题:FOXM + MiRNA ; 参考:《基因组学与应用生物学》2015年09期


【摘要】:为探究人卵巢癌OVCAR3细胞FOXM1基因敲减前后miRNA表达差异,并建立FOXM1相关miRNA差异表达谱,我们应用感染复数为20的靶向FOXM1 shRNA慢病毒颗粒及阴性对照慢病毒感染人卵巢癌OVCAR3细胞96 h,此后提取并鉴定细胞总RNA,纯化分离miRNA,应用高通量miRNA芯片技术分析2组miRNA的表达差异,并对5倍以上差异表达的miRNA进行RT-PCR验证。通过实验我们共发现34个miRNA发生表达变化,其中上调超过5倍的miRNA 4个:miR-327、miR-505、miR-1297、miR-122;下调超过5倍3个:miR-21、miR-409-3p、miR-200a,其中miR-122、miR-1297、miR-21、miR-200a等4个miRNA经RT-PCR验证为真实差异表达。这表明我们成功建立人卵巢癌OVCAR3细胞FOXM1相关miRNA差异表达谱,所筛选出的差异表达miRNA可能与FOXM1具有密切调控关系。
[Abstract]:To investigate the difference of miRNA expression before and after FOXM1 gene knockout in human ovarian cancer OVCAR3 cells, and to establish the differential expression profile of FOXM1 related miRNA. Human ovarian cancer OVCAR3 cells were infected with 20 target FOXM1 shRNA lentivirus particles and negative control lentivirus for 96 h. After that, the total RNAs were extracted and identified, the miRNAs were purified and isolated, and the difference of miRNA expression between the two groups was analyzed by high-throughput miRNA chip technique. The miRNA differentially expressed more than 5 times was confirmed by RT-PCR. A total of 34 miRNA expression changes were found in the experiment, of which 4: miR-327nmiR-505miR-505miR-1297 miR-122 were up-regulated, and 3 miR-21miR-409-3pmmiR-200adown-regulated. Four miRNAs including miR-122mmiR-1297miR-21 miR-200a were confirmed as true differentially expressed by RT-PCR. These results suggest that we have successfully established the differentially expressed miRNA profiles of FOXM1-associated miRNA in human ovarian cancer OVCAR3 cells, and the differentially expressed miRNAs may be closely related to FOXM1.
【作者单位】: 赣南医学院第一附属医院妇产科;
【基金】:国家自然科学基金项目(81260385)资助
【分类号】:R737.31

【共引文献】

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